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環(huán)球關(guān)注:追溯癌癥的祖先 新軟件從腫瘤遺傳物質(zhì)準(zhǔn)確推斷血統(tǒng)

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日期:2023-01-03 17:33:41    來(lái)源:科技日?qǐng)?bào)    


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科技日?qǐng)?bào)記者?張夢(mèng)然

美國(guó)冷泉港實(shí)驗(yàn)室研究人員正在努力揭示癌癥與種族/民族之間的家譜聯(lián)系。他們開(kāi)發(fā)的新軟件,可從腫瘤DNA和RNA中準(zhǔn)確推斷出血統(tǒng)。這些工作還可幫助臨床醫(yī)生制定早期癌癥檢測(cè)和個(gè)性化治療的新策略。研究成果近日發(fā)表在《癌癥研究》雜志上。

知道祖先來(lái)自哪里,會(huì)是更好的癌癥治療關(guān)鍵嗎?答案可能存在于包含數(shù)十萬(wàn)份腫瘤樣本的龐大數(shù)據(jù)庫(kù)和醫(yī)院檔案中。

研究人員表示,為什么不同種族/民族的人對(duì)不同癌癥的患病率不同?可能是他們有不同的習(xí)慣、生活條件等各種社會(huì)和環(huán)境因素,但也可能有遺傳成分。

研究團(tuán)隊(duì)使用混合DNA圖譜訓(xùn)練其軟件工具,從已知背景的癌性和無(wú)癌癥基因組中創(chuàng)建這些圖譜。然后,他們測(cè)試了該軟件中已知血統(tǒng)患者的胰腺癌、卵巢癌、乳腺癌和血癌標(biāo)本的性能。研究發(fā)現(xiàn)該軟件能以超過(guò)95%的準(zhǔn)確率將創(chuàng)建的混合圖譜與種群相匹配。

研究團(tuán)隊(duì)還加入了一項(xiàng)結(jié)直腸癌聯(lián)合研究。該研究使他們能夠探索結(jié)直腸癌如何根據(jù)特定種族/民族以不同的方式突變基因。他們希望進(jìn)一步完善這一軟件,未來(lái)不僅推斷出整個(gè)基因組的祖先,還能推斷其中每個(gè)序列的祖先。

研究人員稱(chēng),如果能夠識(shí)別出更易患癌癥或其他侵入性疾病的祖先,軟件將可幫助確定基因組中負(fù)責(zé)癌癥的特定部分并進(jìn)行靶向治療?!艾F(xiàn)在,一個(gè)簡(jiǎn)單的DNA拭子可告訴你來(lái)自哪里,以及會(huì)遺傳哪些疾病。將來(lái),它也可能給你打敗疾病的手段?!?/p>

癌癥與遺傳基因、生活習(xí)慣、生活環(huán)境等因素有著密切的關(guān)聯(lián),這些因素都可以成為研究癌癥的重要線索。順藤摸瓜地沿著這些線索去探尋癌癥的起因,都很有可能找到對(duì)癌癥的預(yù)防或治療富有價(jià)值的信息:如果發(fā)現(xiàn)某些生活習(xí)慣或生活環(huán)境容易招致癌癥,我們就可以提前避而遠(yuǎn)之;從遺傳基因的維度深究下去,則有助于從基因組中尋找對(duì)癌癥進(jìn)行靶向治療的關(guān)鍵信息。

關(guān)鍵詞: 遺傳物質(zhì)

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