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我國科研團隊獲得接近完整組裝的白菜基因組

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日期:2023-02-16 17:24:59    來源:科技日報    


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科技日報記者 馬愛平 通訊員 陳旭

近日,中國農(nóng)業(yè)科學院蔬菜花卉研究所分子育種創(chuàng)新團隊研究獲得接近完整組裝的白菜基因組,揭示白菜著絲粒的快速進化特征。相關研究成果在線發(fā)表在《植物生物技術》(《Plant Biotechnology Journal》)上。

白菜參考基因組Chiifu?v4.0的著絲粒特征分析。中國農(nóng)業(yè)科學院蔬菜花卉研究所供圖

白菜是世界上栽培歷史最悠久的蔬菜作物之一,是我國栽培面積最大的葉用蔬菜。作為蕓薹屬作物中第一個完成基因組測序的物種,白菜參考基因組為白菜作物的基因組研究和遺傳改良奠定重要基礎。但是,目前的白菜參考基因組仍然存在幾百個缺口,其10條染色體的著絲粒結(jié)構(gòu)組裝均不完整。

該團隊利用三代測序技術,獲得接近完整的白菜基因組。該基因組填補了白菜基因組中絕大多數(shù)缺口,完成了8條染色體從端粒到端粒的完整組裝,僅有2條染色體仍存在一個缺口;該基因組是目前組裝最為完整的白菜基因組。研究還發(fā)現(xiàn)著絲粒區(qū)域長末端重復序列的平均插入時間為14萬年,顯著晚于泛著絲粒區(qū)域,表明白菜的著絲粒區(qū)域經(jīng)歷著快速進化。

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